11 февраля 2002 г. Папа Иоанн Павел II возвел Апостольские администратуры для католиков латинского обряда в России в достоинство епархий с целью укрепления в них пастырской деятельности. Новые епархии объединены в церковную провинцию (митрополию).
Его Святейшеством установлены:
- архиепархия Божией Матери с центром в Москве,
- епархия св. Климента с центром в Саратове,
- Преображенская епархия с центром в Новосибирске,
- епархия св. Иосифа с центром в Иркутске.
Митрополию возглавляет архиепархия Божией Матери с центром в Москве, три другие вышеупомянутые епархии получили статус епархий-суффраганов.

Иоанн Павел II назначил:
Его Высокопреосвященство монсеньора Тадеуша Кондрусевича (до сего времени - титулярного архиепископа Иппоно-Заритского, Апостольского администратора севера европейской части России) архиепископом архиепархии Божией Матери  с центром в Москве,  с возведением в достоинство митрополита;
Его Преосвященство монсеньора Клеменса Пиккеля (до сего времени - титулярного епископа Кузиры, Апостольского администратора юга европейской части России) епископом епархии св. Климента с центром в Саратове;
Его Преосвященство епископа Иосифа Верта (до сего времени - титулярного епископа Бульны и Апостольского администратора Западной Сибири) епископом Преображенской епархии с центром в Новосибирске;
Его Преосвященство монсеньора Ежи Мазура (до сего времени - титулярного епископа Табунии, Апостольского администратора Восточной Сибири) епископом епархии св. Иосифа с центром в Иркутске.

Заявление директора пресс-центра Святого Престола Хоакина Наварро-Валльса:
Святейший Отец возвел в достоинство епархий четыре Апостольские администратуры в Российской Федерации, объединив их в единую митрополию.
Тем самым Католическая Церковь в России обрела нормальные, с точки зрения Канонического Права, структуры. Речь идет о законном административном акте, продиктованном необходимостью улучшить пастырское попечение о католиках, проживающих на огромной территории. Кроме того, это соответствует непрестанным просьбам самих верующих.
Апостольские администратуры - структуры, по своей природе, временные и экстраординарные; их создание продиктовано особыми местными условиями и предполагает в дальнейшем преобразование в епархию. Цель настоящего решения Святейшего Престола - привести организацию католических общин России в соответствие с формами, предусмотренными Каноническим Правом.
В действительности этот шаг продиктован тем же стремлением обеспечить должное пастырское попечение о верующих, которым Русская Православная Церковь руководствуется, учреждая епархии и другие формы церковной организации для своих верующих, проживающих в диаспоре (так, в Европе существуют Венская, Берлинская и Брюссельская епархии РПЦ). За католиками в России должно быть признано право на самоорганизацию и пастырское попечение, которыми обладают православные, проживающие на Западе.
Католическая Церковь надеется благодаря настоящей реорганизации улучшить диалог и сотрудничество с РПЦ, которой она всегда оказывала всяческую поддержку, в том числе, через различные католические структуры (например, организация "Помощь Церкви в беде" за последние десять лет пожертвовала на нужды РПЦ более 17 млн. долларов).
Со стороны правительства Российской Федерации не прозвучало недовольства в связи с этим, т. к. членство в Организации по безопасности и сотрудничеству в Европе (ОБСЕ) обязывает к исполнению Венской декларации, в п. 16 ■4 которой сказано, что "страны-участницы уважают право религиозных общин на самоорганизацию в соответствии с их иерархической и институциональной структурой".

11 февраля 2009 г. торжественным богослужением в Вероне (Италия) была открыта епархиальная стадия процесса беатификации Апостольского протонотария Бернардо Антонини.
Апостольский протонотарий прелат Бернардо Антонини скоропостижно скончался в Караганде рано утром 27 марта 2002 г. Более десяти лет своей жизни о. Бернардо посвятил пастырскому служению католикам России. Мы навсегда сохраним светлую память об этом удивительном человеке, истинном подвижнике и духовном отце.
Монсеньор Бернардо Антонини родился 20 октября 1932 г. в г. Тренто (Италия). Был рукоположен во священники 26 июня 1955 г. в кафедральном соборе Вероны. Получил докторскую степень в области иностранных языков в Католическом Университете Святейшего Сердца Иисуса в Милане, степень лиценциата в области богословия на Папском Богословском факультете в Милане. Изучал Священное Писание в Папском Библейском Институте в Риме и Государственном университете в Иерусалиме.
В 1956-1972 гг. - профессор древних и современных языков семинарии в Вероне. Одновременно выполнял разные пастырские функции. В 1978-1991 гг. - директор курсов постоянной формации священников.
В течение 10 лет монсеньор Бернардо Антонини работал в Апостольской администратуре для католиков латинского обряда европейской части России. Отвечал за проведение многочисленных конференций, семинаров и пастырских встреч. С его именем связано основание Высшей духовной семинарии "Мария - Царица Апостолов" в Санкт-Петербурге (ректор семинарии в 1993-1999 гг.), "Радио Мария" в Москве и Санкт-Петербурге, российской католической газеты "Свет Евангелия" (в 1994 г. - главный редактор; в 1995-2001 гг. - генеральный директор; с октября 2001 г. - почетный генеральный директор) и журнала "Theologia". Декан Колледжа католической теологии им. Фомы Аквинского в Москве, основатель Пастырского института им. св. Иоанна Златоуста.
В 1999 г. возведен в достоинство Апостольского протонотария. В 1999-2000 г. возглавлял комиссию "Юбилей - 2000". Посетил почти все российские приходы, проповедуя о смысле и богословском измерении Великого Юбилея.
С августа 2001 г. работал в Карагандинской Епархии в Казахстане как вице-ректор епархиальной Высшей духовной семинарии "Мария - Матерь Церкви", Епископский викарий по вопросам пастырской деятельности, декан центрального региона Карагандинской области, главный редактор казахстанской газеты "Кредо" и секретарь Совета священников.

11 февраля 2010 г. Ассоциация друзей дона Бернардо Антонини проводит в храме Лурдской Божьей Матери в Санкт-Петербурге встречу, посвящённую годовщине начала епархиальной стадии процесса беатификации Слуги Божия Бернардо Антонини.
В программе - месса, свидетельства, концерт,  чаепитие с воспоминаниями о доне Бернардо.